Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccna1Q61456 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms