Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd53Q61451 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms