Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift88Q61371 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms