Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2bQ61313 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2bQ61313 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms