Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AcanQ61282 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AcanQ61282 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AcanQ61282 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AcanQ61282 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms