Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsg101Q61187 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsg101Q61187 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms