Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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Trpc6Q61143 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Trpc6Q61143 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpc6Q61143 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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