Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinQ61043 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinQ61043 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinQ61043 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinQ61043 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinQ61043 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinQ61043 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinQ61043 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinQ61043 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinQ61043 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinQ61043 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinQ61043 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NinQ61043 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NinQ61043 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinQ61043 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinQ61043 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinQ61043 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinQ61043 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinQ61043 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinQ61043 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinQ61043 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinQ61043 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinQ61043 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms