Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxg1Q60987 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxg1Q60987 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms