Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JrkQ60976 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
JrkQ60976 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrkQ60976 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms