Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik1Q60934 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik1Q60934 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik1Q60934 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik1Q60934 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik1Q60934 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik1Q60934 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms