Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DbpQ60925 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DbpQ60925 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms