Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf4Q60793 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klf4Q60793 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms