Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn2dQ60773 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdkn2dQ60773 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2dQ60773 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2dQ60773 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2dQ60773 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2dQ60773 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2dQ60773 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms