Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf4Q60722 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcf4Q60722 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms