Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561Q60720 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms