Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgaeQ60677 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms