Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sik1Q60670 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik1Q60670 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms