Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmtk3Q5XJV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lmtk3Q5XJV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmtk3Q5XJV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms