Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a3Q5XF89 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms