Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NotoQ5TIS6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms