Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsr1Q5SWD9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms