Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluhQ5SW19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms