Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms