Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930512M02RikQ5SQK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms