Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf12Q5SPL2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms