Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d4Q5RJF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms