Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttf2Q5NC05 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf2Q5NC05 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms