Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp28Q5I043 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp28Q5I043 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp28Q5I043 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms