Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SynaQ5G5D5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SynaQ5G5D5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SynaQ5G5D5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms