Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ecm2Q5FW85 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm2Q5FW85 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms