Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AY761185Q5ERI8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AY761185Q5ERI8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms