Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam208bQ5DTT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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