Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf2Q59J78 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms