Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc47Q505F5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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