Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa3Q505D7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms