Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phactr4Q501J7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phactr4Q501J7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phactr4Q501J7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms