Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt35Q497I4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt35Q497I4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt35Q497I4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms