Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SvipQ3UZP4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SvipQ3UZP4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 479.1 ms