Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrfip1Q3UZ39 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms