Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncbp1Q3UYV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncbp1Q3UYV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncbp1Q3UYV9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms