Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5aQ3UXZ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms