Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn13Q3UW68 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn13Q3UW68 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms