Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnga4Q3UW12 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga4Q3UW12 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms