Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn4Q3UV66 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slfn4Q3UV66 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms