Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trat1Q3UU67 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trat1Q3UU67 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms