Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B3gnt6Q3USF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B3gnt6Q3USF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms