Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf48Q3US17 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms