Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mccc2Q3ULD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc2Q3ULD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms