Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc61Q3UJV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms